Sistem kepemimpinan yang diterapkan di Pondok Pesantren Miftahul Mubtadiin Krempyang Tanjunganom Nganjuk pada mulanya adalah menganut manajemen tradisional yaitu sentralisasi kepemimpinan atau kepemimpinan tunggal.
Kemudian mengingat perkembangannya yang setiap tahun semakin bertambah maka untuk memperkuat eksistensi pesantren sebagai lembaga pendidikan yang sangat mengakar di masyarakat, pada tahun 2006 didirikanlah Lembaga Islam Al-Ghozali ( LIGA ) sebagai badan tertinggi yang menaungi berbagai unit pendidikan dan usaha-usaha yang ada. Yang kemudian disempurnakan dengan dibentuknya Yayasan Islam al Ghozali (YIGA) pada tahun 2010.
Pimpinan Yayasan Islam Al Ghozali (YIGA)
Dewan Penasehat
Dewan Penasehat Yayasan Islam Al Ghozali terdiri atas:
- Bani Al Marhum KH. Moh. Ghozali Manan
- Dewan Pengasuh Pondok Pesantren Miftahul Mubtadiin Krempyang
Unsur Pimpinan
Sebagai Lembaga Mandiri yang berbadan hukum, Yayasan Islam al Ghozali dipimpin oleh seorang ketua dimana dalam pelaksanaan tugas hariannya dibantu oleh Wakil ketua, sekretaris dan wakil sekretaris, bendahara dan wakil bendahara. Secara rinci, susunan pengurus Yayasan Islam al Ghozali adalah sebagai berikut:
Ketua : KH. Moh. Ridlwan Syaibani
Wakil Ketua : KH. Moh. Hamam Ghozali
Sekretaris : H. Nur Salim Ghozali
Wakil Sekretaris : M. Toha Mahsun
Bendahara : H. Imam Muhtadi
Wakil Bendahara : H. Moh. Markub